État de la situation : L’identification et la quantification des pathogènes est importante dans une gestion intégrée des cultures. La quantification des spores à l’aide de binoculaire est laborieuse. Elle exige du temps et un personnel formé et persévérant.

Objectif : Identifier des spores, les quantifier et évaluer leur résistance aux pesticides dans un court délai.

Démarche : Analyser les échantillons obtenus dans différentes cultures, sur des bâtonnets, dans le sol ou sur des tissus, et les séquencer afin de concevoir des marqueurs moléculaires spécifiques aux agents pathogènes ciblés.

Notre recherche se concentre sur :

• Le développement de marqueurs moléculaires quantitatifs adaptés aux besoins des producteurs et conseillers
• L’identification des relations entre l’inoculum, le développement de symptômes et l’influence du climat sur les maladies
• Le développement et la validation de patrons d’échantillonnage
• Le suivi des populations résistantes aux fongicides
• Le développement de stratégies de lutte intégrée grâce notamment à ces outils